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111年8月27日
資通安全處移撥至數位發展部資通安全署
行政院111 年8 月25 日院臺人字第1110185150 號令修正
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111年7月27日
科技會報辦公室移撥至國家科學及技術委員會
行政院111年7月27日院臺人字第1110182365號令
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111年4月25日
增設人權及轉型正義處
行政院111年4月25日院臺人字第1110171545號令
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105年8月1日
增設資通安全處
行政院105年7月30日院臺人字第1050168936號令
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103年10月22日
增設食品安全辦公室
行政院103年10月22日院臺人字第1030151340號令
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103年7月2日
發言人辦公室改為新聞傳播處、會計處改為主計處
行政院103年6月30日院臺人字第1030139099號令
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101年5月20日
配合新聞局於101年5月20日裁撤,相關業務整併至行政院院本部,訂定發言人辦公室及其職掌相關條文之施行日期
行政院101年3月3日院臺人字第1010124056號令
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101年4月20日(設置要點生效日)
增設雲嘉南區聯合服務中心
行政院101年4月30日院臺人字第1010129615號令
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101年1月1日
行政院設綜合業務處、內政衛福勞動處、外交國防法務處、交通環境資源處、財政主計金融處、經濟能源農業處、教育科學文化處、消費者保護處、性別平等處、國土安全辦公室、災害防救辦公室、法規會等12個業務單位;公共關係處、秘書處、人事處、政風處、主計處、資訊處等6個輔助單位;並設科技會報辦公室、資通安全辦公室、中部、南部、東部聯合服務中心等5個任務編組(共23個單位)
行政院100年10月27日院臺人字第1000105050號令
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100年7月15日
增設資通安全辦公室
行政院100年3月7日院臺經字第1000093156號函、原人事室100180101239號簽
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98年11月5日
增設災害防救辦公室
行政院98年11月6日院臺內字第0980065513號函
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97年7月27日(設置要點生效日)
增設東部聯合服務中心
行政院97年7月27日院臺秘字第0960089313號函
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96年8月23日
反恐怖行動管控辦公室改制為國土安全辦公室
行政院96年8月23日院臺人字第0960090580號函
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93年12月1日
原由第五組兼辦之資訊(OA)小組改制為資訊室
行政院秘書長93年11月23日院臺人字第0930091735號函
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93年11月22日
增設反恐怖行動管控辦公室
行政院93年12月31日院臺人字第0930093033號函
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92年1月30日 (設置要點生效日)
增設中部聯合服務中心
行政院92年1月30日院臺秘字第0920081795號函
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87年6月1日
增設南部聯合服務中心
行政院87年3月27日台八十七秘字第12727號函
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81年9月16日
人事室(二)改制為政風室
行政院秘書處81年9月16日臺八十一字第31592號函
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79年3月8日
參秘室改制為國會聯絡組
行政院秘書處79年3月8日台七十九人字第04358號函
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68年10月4日
科技顧問團改為科技顧問組
行政院秘書處68年10月4日台六十八字第9885號函
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61年6月12日
機要室、編譯室及第八組裁撤,增設秘書室
行政院61年6月12日台六十一人室函字第73號通知
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58年10月24日
增訂安全室編制表
行政院秘書長58年10月24日台五十八人字第8699號函
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57年12月18日
配給室裁撤業務移交行政院人事行政局
行政院秘書處57年12月18日台五十七配字第9935號函
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56年7月
主計室更名為會計室
行政院秘書處56年8月2日台五十六人字第5836號函
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54年7月1日
圖表室納入行政院編制
行政院54年7月7日台(五四)忠三字第11926號令
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49年11月24日
原第六組改制為第八組、並增設第六組
行政院秘書處49年11月24日台四十九人字第6559號函
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44年11月1日
制定公布配給室組織規程
行政院44年11月1日台四十四人字第6322號令
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43年6月2日
增設第七組
行政院台43年6月2日四十三(人)字第3461號令
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43年1月1日
裁撤政府發言人辦公室,改設二級機關新聞局
行政院43年1月9日台四十三(人)字第0138號呈
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39年
行政院設第一組、第二組、第三組、第四組、第五組、第六組、機要室、參諮議室、人事室、主計室、編譯室、法規委員會、訴願審議委員會、政府發言人辦公室(共14個單位)
行政院39年職員錄、行政院第126次會議決議、行政院39年8月11日臺三十九(人)字第4207號令
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36年4月22日
行政院組織法修正公布,並增設得分組辦事條文。
36年4月22日國民政府公報